云南中医药中等专业学校是1998年经云南省教育厅批准举办的全日制普通中等专业学校，2021年业务主管部门调整为盘龙区教育体育局。2008年经教育部评估认定为国家级重点中等职业学校,2009年经教育部和财政部批准建设国家级护理实作实训基地,2012年学校荣获云南省第三届“黄炎培职业教育优秀学校”，2015年经中国社会组织评估为4A级单位，2023年9月学校被评为昆明市盘龙区最美奋斗集体，学校的思政实践创新小队、护理教学团队都被评为云南省“优秀教学团队”。2023年12月学校在“共建共治共享 齐创幸福盘龙”的基层治理工作中荣获优秀单位称号。学校还曾被省教育厅评为“云南省中等职业学校教育教学质量优秀中等职业学校二等奖”，省民政厅授予“云南省民办非企业单位自律与诚信建设活动先进单位”荣誉称号。